微波干燥殺菌主要適合于高含水量產品的干燥。由于水的汽化熱很高，因此需要相當大的能量才能有效干燥，所以，只在常規干燥不太有效區段利用，微波能才比較經濟合理。在含水量大的物料中，盡可能先用機械方法（如吸水、擠壓或離心手段）去除水分，然后使用常規熱風干燥爐，用熱風吹過物料表面來提供所需的汽化熱。微波干燥殺菌技術的效率，隨著干燥的進行而下降。主要是因為表面蒸發速率越過物料內部水分向表面的遷移速率。于是出現外干內潮的現象。加之一般干燥物料導熱低，因而干燥過程變得十分緩慢。結果使得干燥爐有效長度增加、占地增大，而且由于干燥爐體熱損失引起能量的浪費。
　　在干燥速率開始下降的低含水干燥區段，利用微波能的滲透加熱特性，可使物料內部的殘留水份很快地向表面遷移蒸發。此外，常常也向微波干燥器中鼓入熱風，以便更有效地排出水汽‘獲得更好的經濟效益。
　　微波干燥殺菌設備主要用于橡膠制品的連續硫化。由于橡膠熱傳導差，采用常規加熱硫化往往需要很長時間，才能使制品整個斷面達到所需的硫化溫度。而且，常出現表面過硫化或中心欠硫化的缺陷。由于微波干燥殺菌設備微波能的體積加熱特性，可在很短時間內將橡膠制品整個斷面加熱到所需的溫度，然后進入一個常規加熱的保溫通道，其主要目的是防止橡膠在發生硫化反應前冷卻，在保溫通道中沒有熱量轉移至橡膠中，其效率可由表面的熱損耗來控制。在理想情況下，微波干燥殺菌設備系統中產品所需的全部熱量都可由微波能提供，但在實際連續生產中，由于擠壓速度，橡膠種類和截面積等都變化很大，所以，在某些情況下，只能有大部分能量是由微波提供，而熱的平衡仍用常規方法。