微波殺菌設備殺菌的溫度場與電磁場相比較，電磁場是細菌致死的主要因素，特別是在較低溫度時是既能殺菌又能保持食品風味和品質的有效途徑。一般而言，電磁場殺菌是指104~1011Hz頻率段的電磁波。電磁場在殺菌過程中表現出來的“非熱因素成為細菌致死的主導因素“打破了常規加熱殺菌的格局，細菌欲生存而需抗爭的對象稱為“電磁力”。細胞是基本的生命單元，當電磁場達到一定值（E＞E0，H＞H0）時，細胞膜就會發生不可修復的破裂，我們把這種現象稱為電穿孔。同時，由于電磁場的不斷變化，在短的時間內，電磁波的頻率、電磁場的強度都會發生較大的變化，在細胞膜上產生振蕩效應。不可逆的電穿孔和激烈的振蕩效應能使細胞破裂，這種破裂導致細胞結構紊亂，從而達到殺菌的目的

　　應用微波殺菌設備來處理食品具有以下特點：殺菌時間短、速度快.低溫殺菌可保持食物的營養成份不流失.且殺菌均勻*，節約能源,可實現自動化生產：微波設備操作簡便，沒有熱慣性，能根據生產工藝要求即開即用，實時調控。整條生產線只需1~2名操作工。微波殺菌設備不需要鍋爐、復雜的管道系統，只需水、電基本條件即可，對廠房無特殊要求。