在過去20年間的研究中，RNA研究的主要方向多關注于編碼蛋白的mRNA及其在細胞過程中的功能，比如疾病和發育等。但是隨著研究的不斷深入，研究者陸續發現了多種非編碼RNA在生命過程中起著重要的調控作用，例如microRNA，siRNA，piRNA以及眾多長片段非編碼RNA。zui近，研究人員逐漸認識到人類基因組中有至少10000個不編碼蛋白的轉錄本，其長度在200個堿基以上，這一類非編碼RNA被定義為長鏈基因間非編碼RNA，longintergenicnon-condingRNA（lincRNA）。到目前為止，只有其中的一小部分具有功能注釋。
lincRNA是一類位于編碼蛋白基因之間，長度超過200nt的長鏈非編碼RNA。lincRNAs起初被認為是基因組轉錄的“噪音”，是RNA聚合酶II轉錄的副產物，不具有生物學功能。
然而，近期在轉錄組分析中的進展表明lincRNAs與多種細胞功能有密切關系。比如：
?調控mRNA轉錄和轉錄修飾
?阻塞/啟動轉錄因子結合
?激活和轉運轉錄因子
?與輔助蛋白結合
近年來的研究表明，這些lincRNA在疾病（包括癌癥）的發生和發展過程中起著十分重要的作用。像miRNA一樣，lincRNA在疾病診斷和治療上也代表了另一個重要的分子來源。lincRNA表達水平上的差異或某些癌癥類型特異型lincRNA的表達，可作為腫瘤診斷和治療的新分子標志物。例如lincRNADD3（也稱PCA3）已被定位前列腺癌高度特異的核酸分子標志物，其特異性高于血清前列腺癌特異性抗原（PSA）。還有研究發現，lincRNA可能與大腦發育，調節精子成熟，神經退行性疾病等過程密切相關。
為了滿足研究者對于轉錄本的研究需要，Affymetrix設計了新一代全轉錄本芯片，GeneChip®HumanGene2.0STArray，在一張芯片上可以同時檢測mRNA和lincRNA。在其上一代1.0STArray的基礎上，該芯片內容進一步豐富并更新數據庫，2.0STArray有更多的優點：
1.全面覆蓋轉錄組，可以同時檢測>30,000個編碼的轉錄本和>11,000個長鏈非編碼轉錄本
2.探針設計zui大程度覆蓋所有外顯子，可檢測選擇性拼接/轉錄本變體。每個轉錄本覆蓋特異探針的數目中值達到21種，每種探針的長度為25bp，這意味著每個轉錄本將被檢測的堿基數中值高達525個。高度的覆蓋度將為使用者提供優異的表現和數據可靠性。
