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研究,科學家已在世界上zui大的癌癥藥物研發數據庫(canSAR)中增添了突變蛋白的3D結構數據和癌癥網絡,相關的研究發表Nucleic Acid Research雜志上。
由倫敦癌癥研究機構(ICR)研發的該數據庫能夠幫助倫敦以及*的科學家更有效的設計癌癥治療方案。2011年,ICR機構的癌癥研究中心的研究人員建立了canSAR數據庫,建立該數據庫的目的是利用大數據的方法來建立一個詳細的描述已知人類分子作用的圖譜。
canSAR數據庫已經收集了數十億的實驗檢測信息,描述了一百萬種能夠對人類蛋白產生作用的藥物和化學物質,同時該數據庫還將這些數據與基因信息數據以及臨床實驗數據合并在一起。
的版本的canSAR數據庫使用人工智能技術來鑒別于癌癥有關的 異常蛋白表面的凹陷處和縫隙,這一步對于設計藥物是非常關鍵的(藥物封閉活性部位)。canSAR同樣能夠允許科學家鑒別腫瘤細胞內部的交流線,為找到新的癌癥治療方法提供了新思路。
這個仍在增長的數據庫當前擁有幾乎110,000種分子的300萬種蛋白凹陷的三維結構。
英國癌癥研究與ICR一起確保這些資源對于*的科學家來說是免費的,他們給這些科學家提供了zui及時的關鍵信息。
ICR機構的計算機生物學家Bissan Al-Lazikani博士是該項目小組的,他說道:“我們數據庫信息一直在更新和增長,目前已經是世界上zui大的癌癥數據庫,有超過175個國家的140,000科學家為我們數據庫的使用者,我們會定期的研發新的智能技術來幫助科學家做出預測和設計實驗,我們的目標是癌癥科學家能夠使用這些數據成為生命拯救者,去完成未來zui令人興奮的癌癥藥物的研究。”
科學家需要找到所有與異常基因或蛋白有關的信息,以理解新的藥物能否發揮作用。這些信息信息量巨大而且分散,但是canSAR數據庫將相關信息整合到一起因為能夠識別隱蔽的和更容易地提供關鍵信息而增添了自身價值。
Paul Workman教授是ICR機構的行政負責人,他說道:“canSAR數據庫是大數據技術中非常重要的一部分,能夠幫助科學家更有效地理解和治療癌癥,該數據庫是非常有力的資源能被*的研究人員使用,以幫助他們更快更方便的獲得生物學、化學以及癌癥藥物的相關知識。的研發已經在很大程度上提升了該數據庫的力量,能夠幫助科學家去選擇未來癌癥藥物zui有可能的靶向位點以及幫助他們更快更有效地實現癌癥藥物創新,這對*的癌癥病人來說是非常有利的”。
英愛癌癥研究的科學信息管理員Kat Arne說道:“這個數據庫包含大量的詳細的科學信息,它將會促進癌癥藥物研發的進步,并zui終拯救更多的生命。癌癥藥物研究是一個長期而且昂貴的過程,所以任何能夠縮短時間和減少成本的方法都會加速新的癌癥治療方法的出現”。