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    傅里葉變換近紅外光譜儀具有高度特征性，除光學異體外，每種代合物都有自己的紅外吸收光譜。因此紅外光譜法特別適用于鑒定有機化合物、高聚物以及其他復雜結構的自然及人工合成物。在生物化學中還應用于快速鑒定細菌，甚至于可以對細胞和其它流行性組織結構進行研究。它克服了色散型光譜儀分辨能力低、光能量輸出小、光譜范圍窄、測量時間長等缺點。它不僅可以測量各種氣體、固體、液體樣品的吸收、反射光譜等，而且可用于短時間化學反應測量，紅外光譜儀在電子、化工、醫學等領域均有著廣泛的應用。

 

    補償器的作用是使兩束光在到達探測器時，各自都分別以相同的次數通過光學材料制成，當兩束光到達d時，其光程差將隨可移動反射鏡的往復運動而周期性變化。基于光的相干原理，在探測器d處得到的是一個強度變化為余弦形式的信號。傅里葉變換近紅外光譜儀在連續改變光程差的同時，記錄下中央干涉條紋的光強變化，就得到千涉圖，作出此干涉圖函數的傅里葉余弦變換，就得到了光譜。分辯能力主要取決于反射鏡的大移動行程l和移動質量，移動行程越大，分辨能力就越高，一般可移動距離在幾十厘米左右， 也有長達二米的。這樣傅里葉變換近紅外光譜儀可以做到很高的分辨率。而光柵型光譜儀，光柵的刻痕密度受到色散的要求不可能過密，若要達到光譜儀同等的分辨率，光柵的尺寸將要長達米數量級，這給設備和小型化都帶來很大的不便。