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云南省林業科學院現轄科研機構七所（林業研究所、經濟林木研究所、森林保護研究所、林產工業研究所、林業科技信息研究所、熱帶林業研究所、油茶研究所）一院（漾濞核桃研究院）兩園（昆明樹木園、西雙版納熱帶樹木園）兩室（云南瀕特森林植物保護和繁育重點實驗室、云南省森林植物培育與開發利用實驗室）三場站（普文試驗林場、漾濞研究站、廣南研究站）一部（《西部林業科學》編輯部）兩站（人事部博士后科研工作站、大姚核桃研究站）。現擁有在職專業技術人員200人，其中職稱42人，中級職務56人，碩士導師9人，博士、碩士24人，云南省中青年學術和技術帶頭人及后備人才3人，云南省技術創新人才及后備人才16人，云南省專業技術人才4人，享受云南省政府特殊津貼9人，享受國家特殊津貼2人；國家林業科技貢獻獎1人。

云南省林業科學院現已建成科研大樓、重點實驗室、自控溫室、組織培養室及標本樓等共13000平方米。擁有科研設備919臺（其中10萬元以上有14臺，如ZNC-750型植物超微粉碎機；從美國、德國、日本、瑞士等國進口大型儀器設備30多臺），保存植物標本4.3萬份，昆蟲標本4萬份，木材及木材切片標本3500號，具備了較完善的現代實驗手段。在院內以局域網與寬帶并行的方式，實現了網絡互聯。與省林學會聯辦的《西部林業科學》現聘有4位院士擔任編委，曾獲全國科技期刊三等獎、省科技期刊二等獎。現被列入中國林業核心刊物。

近日該院熱帶植物研究所引入中科耐馳公司研發的新型ZNC-750型植物超微粉碎機對熱帶植物根莖葉等部位分別進行有效的超微化處理后，達到破壁效果，熱帶植物根莖葉中所含*成分得到非常有效的利用，為該項目后期推廣產生重大影響。