抗原抗體反應是指抗原與相應抗體之間所發生的特異性結合反應。這種反應既可在機體內進行，也可以在機體外進行。在機體內，當免疫細胞被抗原激活后，由B細胞分化成熟為漿細胞后所合成、分泌的一類能與相應抗原特異性結合的具有免疫功能的球蛋白（immunoglobulin，Ig），激活補體系統從而解除抗原對機體的損傷。

抗原抗體反應的主要特點有：

1、特異性：特定的抗體只能與特定的抗原（肽段/蛋白）結合，這在WB一抗二抗的種屬及反應性的選擇常用到；

2、比例性：抗原抗體在整個反應中存在一定的量比關系，只有當二者濃度比例適當時才出現可見反應；WB中蛋白上樣量和一抗二抗的稀釋比例與此有關，實際操作中抗體的量相對較多，這也是為何抗體可以反復使用的原因之一；

3、可逆性：抗原抗體的結合是非共價結合，在一定條件下這種非共價結合是可逆的；因此，同一NC膜/PVDF膜在Stripping（抗體洗脫）以后可以用來檢測其他蛋白；

4、階段性：抗原抗體特異性反應分兩階段，第一階段反應迅速，第二階段反應緩慢，兩階段均為特異性結合；WB中抗原抗體結合在室溫下，反應1小時結合大約可達95%，2小時大約可達97%以上；反應4-6小時大約可達90%，8小時大約可達95%。