原料藥制成之間的各種產物為醫藥中間體，藥品的合成對中間體有較強的依賴性。醫藥中間體是生產原料藥的重要原料，屬于化工產品范疇，生產廠無需GMP認證。而其生產又具有一定的特殊性，在廠區選址、布局規劃以及廠房設計方面還需嚴格遵循GMP相關要求。與一般化工生產過程不同，醫藥中間體生產過程具有小型化、單批次間歇化和多功能化的特點。

1、小型化

醫藥中間體生產具有小型化的特點，小型化的特點就是反應釜小，原料少且要求精準，尤其是反應過程中流加的液體物料，需要量很小，并且需要控制。如醫藥中間體生產中常見的加氫反應過程就是小規模的間歇反應，主要包括加料過程、置換過程、反應過程、反應后的泄壓過程和出料過程。氫氣、固體物料和液體物料都是加氫反應工藝物料，一般的工藝過程是先加入固體和液體物料，然后在一定的壓力下加入氫氣進行反應，在加料過程中，需要對氫氣外的固體和液體物料的加入進行控制，這也是一個精細的化工過程。

目前，大型制藥企業更專注于提升自身核心競爭力，注重藥物的研發和銷售，為了縮短新藥研發的周期，降低新藥的研發費用，常將中間體外包定制生產，一些公司提供中間體定制合成服務。美迪西提供中間體定制合成服務，可以為客戶合成參考化合物，中間體，候選藥物、雜質以及代謝物等各種小分子化學物質，其規模可從毫克級到千克級（包括GMP質量）。其團隊精通新路線設計和路線優化，憑借解決問題的熟練技能和項目的較高成功率。

2、單批次間歇化

一般的化工生產過程大多為連續化生產，與其不同的是醫藥中間體的生產過程大多是單批次間歇化的，通常為頻繁的單批次生產，需要反復的進行前處理和后處理，并且這些過程需要滿足《藥品生產質量管理規范》要求。在連續過程中，原料連續不斷地通過一組專門設備，每臺設備處于穩態操作并且只執行一個特定的加工任務，產品已連續流動的方式輸出。而間歇化生產指的是原料按規定的加工順序和操作條件進行加工，產品以有限量方式輸出。間歇過程的本質是動態的，操作條件和產品質量會隨著時間而變化。

3、多功能化

醫藥中間體生產中的反應釜通常需要進行多步反應或多種工藝，要求在不同階段進行不同的溫度控制或壓力控制。為了完成這些過程的精確控制，在設計控制方案和儀表選型時就需要考慮滿足大范圍調節的特點。

制藥工業目前占主導地位的是使用間歇反應器的批次處理方法。該方法所使用的帶有攪拌器的反應器適合于大多數制藥行業的單元操作，比如反應，萃取，蒸餾和結晶等，設計間歇過程需要作出更多的決策。而連續處理方法提供了更加可預測的放大路徑，以及一些額外的操作優勢。這些優勢讓越來越多的醫藥企業開始將連續處理作為一種新方法來應用到醫藥中間體和活性藥物成分的實際生產過程中。