全自動菌落計數(shù)儀就是為了減輕工作人員工作強度的，在現(xiàn)今的高技術(shù)下，若還需要估算才能測出菌落數(shù)的話，應(yīng)是比較落后了。*好的是：能“不變應(yīng)變”精準(zhǔn)、穩(wěn)定地傻瓜式操作的分析軟件，其對于菌落形態(tài)和樣品狀態(tài)的不確定性，能夠自動適應(yīng)，以避免不斷地調(diào)節(jié)菌落分割參數(shù)，其*多由對話交互來擦除那些個污染部分，即可。
現(xiàn)在科研、質(zhì)檢部門對于全自動菌落計數(shù)儀的要求也越來越高，上述軟件功能應(yīng)該能夠滿足現(xiàn)在客戶的需要，但是對與一些特殊實驗應(yīng)用面來說，在功能上還有待加強。除軟件功能，另外一點也不得不提，那就是操作。現(xiàn)在越來越講究人機結(jié)合的舒適性，講究產(chǎn)品功能的強大和操作的簡單化成反比。對用用戶來說才算是真正解放。
掃描成像與拍照燈箱的營造均勻面光源不同，是將線光源通過移動變成面光源的，光線強度相對比較均勻，其均勻度通常比拍照燈箱的面光源要高一個數(shù)量級，掃描成像從成像硬件這個根本上解決了菌落目標(biāo)的亮度不勻問題，然而其在菌落表面顏色的表現(xiàn)上遜于從平皿正面的拍照成像。以300dpi分辨率（3482×2396像素成像）掃描6個90mm直徑平皿的速度，暗視野成像約12秒、背光成像約20秒，就其成像速度而言，與單反相機、卡片機拍照成像的速度相當(dāng)。